Tra le più comuni sostanze riscontrabili nei mangimi sottoposti ad analisi spiccano le micotossine; si trovano inoltre diossine, ogm ed altre sostanze contaminanti che sono prontamente individuate dagli specialisti del laboratorio di analisi.
Fondamentale risulta il controllo degli additivi aggiunti ai mangimi, tra i quali: conservanti, aromatizzanti e coloranti, vitamine, aminoacidi, stabilizzatori della flora intestinale.
I principali metodi di analisi sono finalizzati alla ricerca di: Calcio, Carboidrati, Fosforo, Zuccheri, Metalli scambiabili, Grassi, Ceneri, Stafilococchi, Escherichia Coli Enterobatteriacee, Salmonella.